Defensa argentino nacido en Guaymallén con 32 años edad que tuvo su primera aventura en la Liga MX con Xolos de Tijuana para el Apertura 2016 y de cara al Clausura 2017 fue vendido al América.
En su paso por Coapa, Emanuel Aguilera acumuló cerca de 150 juegos en los diferentes torneos como Liga MX, Copa MX, Concacaf Champions League, Campeón de Campeones, Leagues Cup y Campeones Cup.
Con las Águilas del América logró los títulos del Apertura 2019 de la Liga MX, el del Clausura 2019 de la Copa MX y el Campeón de Campeones 2019.
A pesar de que el torneo Grita México Clausura 2022 ya se puso en marcha, el mercado invernal en la Liga MX sigue con actividad. En esta ocasión son América y Atlas los equipos protagonistas de un nuevo movimiento. A falta de un anuncio oficial, el defensor Emanuel Aguilera abandonará Coapa y será nuevo jugador del vigente campeón.