Los gobiernos municipales bajo las banderas de los partidos políticos de ARENA y del FMLN utilizaron fondos de la cooperación internacional para financiar a las pandillas y trataron de camuflar esta actividad al desviar recursos hacia programas sociales de prevención de la violencia que se ejecutaban en sus localidades.
Ilopango, Mejicanos, Ciudad Delgado y Panchimalco (en el departamento de San Salvador), Quezaltepeque (La Libertad) y la de Sonsonate son las alcaldías en las que se incurrió en ese tipo de financiamiento con dinero de la cooperación, principalmente de Estados Unidos. Ante esto, en 2013, ese país dejó de financiar el Programa de Apoyo Temporal al Ingreso (PATI), que estaba destinado a atender a jóvenes mayores de 16 años que no tenían un empleo formal, con la entrega de $100 mensuales (durante un semestre) a cambio de que participaran en proyectos comunitarios y en actividades productivas y sociales.
Cuando la cooperación se suspendió estaba en el poder el primer Gobierno del FMLN, encabezado por el ahora prófugo de la justicia Mauricio Funes, quien tras concluir su gestión fue citado por la Fiscalía General de la República (FGR) para declarar por la tregua que su administración impulsó con los terroristas. Asimismo, cuando ocurrió la cancelación de los fondos de cooperación, el municipio de Ilopango estaba gobernado por el alcalde de ARENA Salvador Ruano, electo para el período 2012-2015.
Las investigaciones de la FGR determinaron, por medio de la Operación Jaque, que el jefe municipal contrató a Marvin Adaly Ramos Quintanilla (alias Piwa, integrante activo de la MS-13) como el responsable de la administración del dinero de esa cooperación dentro de la alcaldía.
Según el proceso penal, la alcaldía de Ilopango le pagaba mensualmente a Piwa entre $300 y $800. Publicaciones internacionales especializadas en temas de seguridad revelaron, en agosto de 2016, que Ruano reconoció que había contratado al Piwa, sin embargo, aclaró que lo hizo por petición de David Munguía Payés, quien era el ministro de la Defensa Nacional en el Gobierno de Funes.
Después de terminar su cargo como ministro, agentes policiales detuvieron a Munguía Payés el 24 de julio de 2020 acusado por la FGR de agrupaciones ilícitas, actos arbitrarios e incumplimiento de deberes por su participación en la tregua con los grupos terroristas. El exfuncionario está en el penal La Esperanza, conocido como Mariona, y su proceso pasó a juicio, por lo que está a la espera de que se dicte la condena. Ruano revalidó su cargo en las elecciones de 2015 para el trienio 2015- 2018, pero falleció en 2017 a la mitad de su gestión.
Años después se conoció que, además de la contratación de Piwa para administrar los fondos de cooperación, también fue mediador en las negociaciones que su partido (ARENA) sostuvo con las pandillas para que respaldaran la candidatura presidencial de Norman Quijano.
Las investigaciones fiscales y periodísticas revelaron que además del Piwa, en Ilopango, cerca de 750 pandilleros recibieron en ese mismo período dinero de la cooperación internacional en las alcaldías de Quezaltepeque, Mejicanos, Sonsonate, Ciudad Delgado y Panchimalco. Las tres primeras, al igual que Ilopango, eran gobernadas por el partido ARENA, mientras que las dos restantes por el FMLN.
El alcalde de Ciudad Delgado en ese entonces era Tomás Minero. Durante su gestión, el Gobierno del presidente Salvador Sánchez Cerén (ahora prófugo de la justicia) declaró a Ciudad Delgado como el primer municipio libre de violencia, pero las pandillas continuaron delinquiendo y asesinando a los pobladores.
