En los diferentes monitoreos y registros de los guardarrecursos del MARN se ha comprobado que El Jocotal alberga 151 especies de flora y 442 de fauna.  

En la laguna convergen 254 especies de aves, de las cuales el 43 % son migratorias y el resto, residentes.

«Este humedal alberga más del 50 % de las aves que se pueden observar en el país. De las 500 especies que existen en el mundo, acá tenemos 254», aseguró Rosalba Alvarenga, técnica del MARN.

A nivel de aves migratorias, hay especies provenientes de Norteamérica, como el pato cucharón, el playerito occidental y el pelícano blanco.

Otras destacables (también viajeras desde el norte del continente) son el pato real, pichinche, cerceta aliazul, la lora nuca amarilla y la garcita de tular, las cuales están amenazadas y en peligro de extinción. 

Entre la fauna local o residente hay 13 especies de anfibios, entre ellos, la rana arborícola y la ranita de quebrada; 33 tipos de reptiles, como el cocodrilo americano y la tortuga candado. Además, se contabilizan 43 mamíferos, entre ellos, el tepezcuintle y el oso hormiguero.

La almeja de agua dulce y 78 insectos, como la libélula y la mariposa, figuran entre los invertebrados. Se registran también 151 especies vegetales entre acuáticas y terrestres, algunas de ellas son el mangle dulce, carreto, pimiento y guayacán, que se encuentran en peligro de extinción.

Aves que habitan la laguna

Tirano tijereta rosada – Tyrannus forficatus : Es un ave migratoria que anida en Norteamérica e inverna en Centroamérica.
FOTO: Diego García.
Martín pescador amazónico – Chloroceryle amazona. Reside en las tierras bajas de los trópicos americanos; viaja desde México a través de Centroamérica y Argentina.
FOTO: Diego García.
Pelícano blanco – Pelecanus erythrorhynchos. Es una especie migratoria que se encuentra en todos los humedales en invierno.
FOTO: Diego García.
Gavilán pescador – Pandion haliaetus. Aparece en todos los continentes, excepto en la Antártida y Sudamérica.
FOTO: Diego García.
Garza dedos dorados – Egretta thula. Es residente permanente en zonas de Florida, costas del sur y tierras bajas del Pacífico, en este último se reproduce.
FOTO: Diego García.

Gavilán caracolero – Rostrhamus sociabilis Se moviliza entre Estados Unidos y Argentina. La especie es considerada residente en el país desde 2010.
FOTO: Diego García.
Mantellina – Jacana spinosa. Habita en los humedales de Centroamérica, el sur de Estados Unidos (ocasional en Texas), México y las Antillas.
FOTO: Diego García.
Garza verde – Butorides virescens. Reside permanentemente en Centroamérica, las Antillas y las Bahamas, es común en áreas tropicales en el mundo.
FOTO: Diego García.
Garza cenizo – Ardea herodias. Las regiones donde se encuentra son Norteamérica, Centroamérica, islas Galápagos y norte de Sudamérica.
FOTO: Diego García.