Uno de los lugares claves que marcó el inicio del movimiento independentista de Centroamérica de la corona española se sitúa en San Salvador, exactamente en la parroquia Nuestra Señora de la Merced.
En el templo se encuentra el campanario donde el prócer José Matías Delgado anunció, junto al repique de la campana, el ánimo que existía de separarse de España. Era la madrugada del 5 de noviembre de 1811.
A las 8 de la mañana de aquel mismo día el prócer Manuel José Arce, ante todo el pueblo reunido en la esquina del ayuntamiento de San Salvador realizó el llamado primer grito por la libertad. «No hay rey, ni intendente ni capitán general, solo debemos obedecer a nuestros alcaldes», dijo.
Además de Delgado y Arce, los protagonistas de este hecho fueron también los hermanos Manuel, Vicente y Nicolás Aguilar.
En el templo se encuentran los archivos de un manuscrito de Delgado donde da fe que estuvo en la parroquia ese 5 de noviembre, pues de acuerdo con el libro resguardado por más de 200 años, el entonces prócer se preparaba a celebrar un matrimonio.
Otro de los documentos oficiales que confirman lo ocurrido en el campanario es el Decreto Legislativo N.° 172, del 19 de septiembre de 1930, en el cual la Asamblea Nacional Legislativa de ese entonces, declaró Monumento Nacional la torre de la iglesia de la Merced porque tiene «un alto valor histórico, por ser la misma desde la cual el Padre de la Patria José Matías Delgado, anunció a toques de campana, que era llegada la hora de proclamar la independencia política de Centroamérica».
Por decreto legislativo, el campanario de Nuestra Señora de La Merced es monumento nacional y pertenece a los bienes culturales de El Salvador.
La Iglesia tiene sus orígenes en 1623. Debido a los terremotos de 1854 y 1873 se trabajó en su reconstrucción finalizando los trabajos en 1895.
En el siglo XX tuvo remodelaciones. Una de ellas fue en 1917 cuando la parroquia sufrió daños en su infraestructura debido a un terremoto, al igual que para el terremoto de San Salvador en 1986. Para 1995 se hizo una restauración arquitectónica del campanario.
